Espectroscopia em herbário com MicroNIR
Teoria e prática
Apresentação
Damos boas-vindas aos participantes do minicurso Espectroscopia em Herbário com MicroNIR: Teoria e Prática! 😊
Este curso foi desenvolvido para capacitar funcionários e bolsistas no uso do espectrômetro portátil MicroNIR, abrangendo desde a configuração inicial do equipamento até a análise dos dados espectrais.
Ao longo de três dias de atividades teóricas e práticas, os participantes explorarão os fundamentos da espectroscopia no infravermelho próximo (NIR) e sua aplicação na identificação de plantas.
Além disso, o minicurso busca identificar desafios práticos no uso do equipamento, contribuindo para o desenvolvimento de um protocolo de aplicação no âmbito do Projeto SpectraPop (saber mais aqui).
Detalhes do minicurso
Onde: Herbário INPA (1º andar, Sala IFN), Av. André Araújo, 2.936 - 69067-375 - Petrópolis, Manaus, Amazonas.
Data: De 02 a 04 de abril de 2025.
Público-alvo: Funcionários e bolsistas envolvidos no fluxo de trabalho do herbário que tenham interesse no uso de espectroscopia portátil para pesquisa científica.
Número de vagas: 13 (participantes previamente selecionados).
Carga horária: 18h (com emissão de declaração de participação).
Formato: Híbrido, com aulas teóricas virtuais e aulas práticas presenciais. Quatro laptops estarão disponíveis para as aulas práticas, e as atividades serão realizadas em quatro grupos.
Material: Slides, scripts e dados obtidos durante o curso serão disponibilizados diretamente aos alunos ou via GitHub.
Observações importantes:
Participantes externos devem apresentar um documento de identificação com foto (p. ex. RG) e informar em qualquer portaria do INPA que estão participando de um treinamento no Herbário INPA.
Para as aulas teóricas, os participantes podem assistir de casa ou utilizar as dependências do INPA. Se este último for o seu caso, por favor, avise-nos com antecedência.
Ao final do minicurso, cada participante deve responder um formulário de aproveitamento para avaliação da capacitação e sugestões para aprimoramento do protocolo de uso do MicroNIR, que futuramente será disponibilizado para toda a comunidade interessada.
Cronograma
Visão geral
As atividades do workshop ocorrerão durante três dias seguidos, de quarta a sexta-feira.
As sessões da manhã serão entre 09h00 e 12h00 (horário padrão do Amazonas).
As sessões da tarde serão entre 14h00 e 17h00 (horário padrão do Amazonas).
Linha do tempo
Dia 1 (quarta-feira)
Manhã (Flávia)
Fundamentos teóricos da espectroscopia NIR e suas aplicações
Link para acessar a aula: https://meet.jit.si/Spectrapop
Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/PTZiQRaphvAgcDwu7
Vídeo Tour do Espectro Eletromagnético (NASA): https://www.youtube.com/watch?v=2p7FPFvu_j0
Tarde (Caroline)
Apresentação do dispositivo NIR-S-G1 (MicroNIR, InnoSpectra Corp.) e acessórios
Configuração do aplicativo ISC-NIRScan GUI (laptop e smartphone)
Calibração, coleta de dados espectrais e cuidados necessários na obtenção dos espectros
Entendendo os arquivos de saída
Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/7Y52iFG1BNhstmey6
Dia 2 (quinta-feira)
Manhã (Caroline)
Exercício prático de aquisição de leituras espectrais - Exemplo com algumas das espécies CITES (Convenção sobre o Comércio Internacional das Espécies Silvestres Ameaçadas de Extinção) listadas abaixo:
| Id | Família | Espécie |
| 1 | Bignoniaceae | Handroanthus barbatus |
| 2 | Bignoniaceae | H. capitatus |
| 3 | Bignoniaceae | H. impetiginosus |
| 4 | Bignoniaceae | H. incanus |
| 5 | Bignoniaceae | H. ochraceus |
| 6 | Bignoniaceae | H. serratifolius |
| 7 | Bignoniaceae | Tabebuia aurea |
| 8 | Bignoniaceae | T. insignis |
| 9 | Meliaceae | Cedrela odorata |
| 10 | Fabaceae | Dipteryx magnifica |
| 11 | Fabaceae | D. odorata |
| 12 | Fabaceae | D. polyphylla |
| 13 | Fabaceae | D. punctate |
Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/ucjn7CXmNSVrbKdH7
Tarde (Caroline)
Instalação das bibliotecas necessárias
Como importar as leituras espectrais para o R
Como visualizar espectros e avaliar a qualidade dos dados espectrais
Como preparar os conjuntos de dados para análise
Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/WnXsJYpzR1aw5kxT8
Dia 3 (sexta-feira)
Manhã (Flávia)
Fundamentos teóricos da espectroscopia NIR e suas aplicações
Link para acessar a aula: https://meet.jit.si/Spectrapop
Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/j6JUzh1RKtncAZT67
Tarde (Caroline)
Análise discriminante (LDA) com validação cruzada Leave-One-Out (LOO)
Avaliação básica dos modelos (acurácia e matriz de confusão)
Responder formulário de aproveitamento do minicurso
Link para acessar a lista de presença: https://forms.gle/BtVwHsepLdAKL55R7
Link para acessar acessar o formulário de feedback: https://forms.gle/jFX8RhJp2MVVybRa9
Equipe de organização e treinamento
👤Profa. Dra. Flávia Durgante (Coordenadora do Projeto SpectraPop), KIT/ MAUA/INPA
👤Dra. Caroline Vasconcelos (Bolsista AT/III do Projeto SpectraPop), INPA
👤Prof. Dr. Michael Hopkins (Colaborador), Curadoria do Herbário INPA
Financiamento
Este minicurso é parte do Projeto “Popularização do uso da Assinatura Espectral da Espécie na identificação das árvores do Manejo Florestal Sustentável na Amazônia - SPECTRA POP”, financiado pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM), Edital no. 006/2024 - Mulher Faz Ciência, e apoiado pelo Herbário INPA via Chamada pública MCTI/FINEP/FNDCT no. 02/2016 – Centros Nacionais Multiusuários.
Contato
Em caso de dúvidas, envie um e-mail para Caroline Vasconcelos e Flávia Durgante em projetospectrapop@gmail.com, com cópia para cc_vasconcelos@hotmail.com e flaviamdflorestal@gmail.com
Participantes
Adriane Maciel
Camila Mayara Gessner
Cecile Cássio
Claudia Eugênio
Francisco Farroñay
Heitor Felippe Uller
Kellin Vanessa Andriguetto
Kely da Silva Cruz
Lourdes Cristina
Marly Castro
Nory Daniel
Ruby Vargas
Samyra Ramos
Ouvintes (participação parcial)*
Maria Clara Ferro - Virtual/Presencial
Natália Deggau da Costa - Virtual
Thiago Caique Alves - Virtual
Marcos Vinicius Vizioli Klaus - Virtual
*Ouvintes (virtuais e presenciais) não terão direito a certificado.